Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) του Τμήματος Μηχανικών Πληροφορικής και Ηλεκτρονικών Συστημάτων του Διεθνούς Πανεπιστημίου της Ελλάδος ιδρύθηκε και λειτουργεί από το Ακαδημαϊκό εξάμηνο 2012-2013 και εγκρίθηκε η συνέχιση λειτουργίας του από το Υπουργείο Παιδείας (ΦΕΚ 2121/21-5-2021). Με βάση το ΦΕΚ Τροποποίησης (τ.Β 1007/12.2.2024), το ΠΜΣ τροποποιήθηκε και στη νέα του μορφή, θα λειτουργήσει από το ακαδημαϊκό έτος 2024-25. Το ΠΜΣ Οδηγεί σε Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (Μ.Δ.Ε.) επιπέδου εκπαίδευσης 7, στο Εθνικό Πλαίσιο Προσόντων.
Το ΠΜΣ απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Σπουδών στις «Ευφυείς Τεχνολογίες Διαδικτύου» εφόσον ο μεταπτυχιακός φοιτητής έχει επιτυχή εξέταση στα προβλεπόμενα από το οικείο πρόγραμμα μαθήματα σε συνδυασμό με τη συμμετοχή του στο σύνολο των εκπαιδευτικών και ερευνητικών δραστηριοτήτων κατά τα ειδικότερα οριζόμενα στο πρόγραμμα και στον οδηγό μεταπτυχιακών σπουδών του τμήματος και τον κανονισμό μεταπτυχιακών σπουδών του ΔΙΠΑΕ.
Η απόκτηση του ΜΔΕ παρέχει την δυνατότητα συνέχισης σπουδών για την απόκτηση Διδακτορικού Διπλώματος.
Η ελάχιστη χρονική διάρκεια σπουδών για την απονομή Μεταπτυχιακού Διπλώματος ορίζεται σε τρία (3) διδακτικά εξάμηνα, στα οποία περιλαμβάνεται ένα εξάμηνο σπουδών για την εκπόνηση της διπλωματικής εργασίας. Ο μέγιστος χρόνος φοίτησης δεν μπορεί να υπερβεί τα 6 ακ. εξάμηνα συνολικά για τη φοίτηση πλήρους παρακολούθησης. Στη διαδικασία μερικής φοίτησης η ελάχιστη διάρκεια είναι 5 εξαμήνων (4 εξάμηνα μαθημάτων και 1 εξάμηνο η Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία-ΜΔΕ) και μέγιστη 9 ακαδημαϊκά εξάμηνα.
Ο αριθμός εισακτέων ορίζεται το πολύ σε τριάντα (30) φοιτητές.
Κάθε διδακτικό εξάμηνο περιλαμβάνει 13 εβδομάδες για διδασκαλία και 2 βδομάδες για τις εξετάσεις.